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在基因組學(xué)研究中，高通量測序是***重要的數(shù)據(jù)來源。然而，高通量測序技術(shù)的飛速發(fā)展，在給基因組學(xué)研究帶來極大便利的同時，也帶來了“幸福的煩惱”：單次測序數(shù)據(jù)量的大幅度提升，使得基因組學(xué)研究從原來的“測的沒有算的快”，變?yōu)槿缃竦摹八愕臎]有測的快”。
厚度超百米的生命天書
基因組的數(shù)量非常大。一個小小真菌，如酵母的基因組總量就有10Mb，而一個人的全基因組是3Gb。如果將全部測序數(shù)據(jù)打成文字排成書，這本書的厚度將超過100米。此外，由于受到技術(shù)和方法學(xué)的***，每個人至少要測100Gb，也就是基因組的30倍以上，才能得到相對準確的全基因組數(shù)據(jù)。
過去，測序的成本非常高。上世紀90年代初期正式啟動的“人類基因組”計劃歷經(jīng)16年時間，花費約30億美元，才完成了一個白種人的全基因組圖譜繪制。而現(xiàn)在，僅需要3天便能完成一個人的全基因組測序，花費在1000美元左右。隨著時間的縮短、價格的降低，基因測序技術(shù)變得更加有“親和力”。尤其是在2013年以后，好萊塢女星安吉麗娜?朱莉通過基因檢測得知，她患乳腺癌以及卵巢癌的風險分別為87%和50%，因此毅然選擇切除了乳腺和卵巢。 這使得基因測序技術(shù)進一步受到廣泛關(guān)注。
“舊時王謝堂前燕，飛入尋常百姓家?！被驕y序已從原來的象牙塔里的技術(shù)，進入更多普通人的生活。
復(fù)雜的基因分析流程
那么，基因測序為何會面臨“算的沒有測得快”？
通過基因測序獲得的只是ATCG四種不同堿基的組合，而這并不是直觀的結(jié)果；要將測序結(jié)果進行解讀，還需要在高性能計算機上進行大量的演算和分析。
在高性能計算機中計算時，需要多個軟件協(xié)同工作，一步一步完成數(shù)據(jù)分析，***終才能呈現(xiàn)出可讀的結(jié)果。得到***終結(jié)果，通常要經(jīng)過樣本采集，提取組織DNA，進入測序儀測序，隨后進入計算機對測序數(shù)據(jù)進行標準化計算，***終進行數(shù)據(jù)的分析、核驗。
提升基因計算應(yīng)用效率
然而，計算分析的過程非常復(fù)雜并且相當耗時，涉及到多款軟件。每個軟件的算法不同，所需要的計算資源不同。如何才能理解軟件所需要的資源，合理配置計算環(huán)境？
采用浪潮“天眼”（TEYE）高性能應(yīng)用特征分析系統(tǒng)（以下簡稱浪潮天眼），可以獲得軟件的運行特征，以便指導(dǎo)資源的配置。
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