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地 址:河南省洛陽市高新區(qū)火炬創(chuàng)業(yè)園
華大基因依托BGISEQ-500平臺強大的測序?qū)嵙Γ瞥鲂詢r比超高的表觀組學研究利器ATAC-Seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin using Sequencing)。該技術通過改造后活性極高的轉(zhuǎn)座酶介導,對染色質(zhì)結(jié)構(gòu)開放區(qū)域進行捕獲測序,僅需少量細胞便可獲得實時全基因組活性調(diào)控序列信息,廣泛應用于轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合分析、核小體定位、活性調(diào)控元件分布等研究,在表觀遺傳機制研究領域有廣闊的應用前景。
技術優(yōu)勢
快速 實驗流程精簡,交付周期更短
微量 所需細胞量少(低至數(shù)百個細胞),適用于臨床樣本
準確 技術重復性好,與同類技術及同類測序平臺一致性高
*** 獲得信息量大(全基因組調(diào)控活性圖譜、全轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合圖譜)
超值 依托華大基因BGISEQ-500平臺強大的測序?qū)嵙?,超高性價比
研究內(nèi)容
標準信息分析
標準信息分析:
1) 數(shù)據(jù)基本處理與質(zhì)控
2) 文庫插入片段長度分布
3) 基因組測序深度累積分布
4) 各樣品基因promoter(up2K)區(qū)測序深度分布
5) Peak檢測
6) Peak長度分布
7) Peak深度分布
8) 樣本生物學重復 IDR 分析
9) Peak在基因功能元件上的分布
10) Peak相關基因
11) Peak相關基因的GO功能顯著性富集分析
12) Peak相關基因的pathway富集分析
13) 樣本間差異peak檢測
14) 樣品間差異peak在基因功能元件的分布
15) 樣品間差異peak相關基因
16) 樣品間差異peak相關基因的GO和KEGG富集分析
***信息分析:
17) 核小體定位分析
18) 轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合分析(需客戶提供感興趣的TF名稱)
19) 全基因組活性圖譜
定制化信息分析
可結(jié)合客戶的需求,協(xié)商確定定制化信息分析內(nèi)容(如ATAC-Seq與RNA-Seq關聯(lián)分析等)。
大量測序需要很大的核酸提取純化實驗量,磁珠法核酸提取純化能夠高通量自動化地進行測序前處理,且測序樣本和其他核酸提取純化樣本的不同之處在于體系體積受限,需要用極小的體系體積完成一系列純化處理過程。
G.N.T.公司生產(chǎn)的核酸提取磁珠能夠很好地完成這一要求,未測序前處理帶來***便捷可靠的產(chǎn)品體驗。
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