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醫(yī)學(xué)研究已經(jīng)迎來(lái)了精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的新時(shí)代,剛剛還在實(shí)驗(yàn)室中應(yīng)用的工具,轉(zhuǎn)眼之間已經(jīng)被應(yīng)用于臨床研究。隨著第二代測(cè)序技術(shù)及生物學(xué)進(jìn)展,腫瘤治療領(lǐng)域也正在經(jīng)歷迅猛的發(fā)展。
腫瘤學(xué)中的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)方法
主要的技術(shù)進(jìn)步通常會(huì)帶來(lái)超越技術(shù)初始目標(biāo)的創(chuàng)新和改變。第二代測(cè)序(NGS)技術(shù)、各種組學(xué)的應(yīng)用、不斷增長(zhǎng)的計(jì)算能力和日益累積的“大數(shù)據(jù)”,將促進(jìn)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)在腫瘤學(xué)中的發(fā)展。
現(xiàn)有技術(shù),尤其是第二代測(cè)序(NGS),已經(jīng)能實(shí)現(xiàn)對(duì)腫瘤基因組進(jìn)行系統(tǒng)性評(píng)估。而基于其性能特征和成本,NGS已經(jīng)可以融入到常規(guī)臨床護(hù)理和藥物研發(fā)中。盡管現(xiàn)在預(yù)測(cè)NGS將在多大程度上改變腫瘤學(xué)還為***早,但是NGS可能成為常規(guī)診斷的重要工具,當(dāng)NGS與基于突變譜的臨床相關(guān)的治療算法相結(jié)合時(shí),將對(duì)患者結(jié)果產(chǎn)生有益的影響。與免疫治療進(jìn)展一道,NGS作為癌癥患者選擇性靶向治療的基礎(chǔ),應(yīng)當(dāng)融入到未來(lái)腫瘤藥物發(fā)展的戰(zhàn)略規(guī)劃中。
在未來(lái),整合系統(tǒng)生物學(xué)方法除包含基因組學(xué)外,還包括表觀基因組學(xué)、通路分析,以及從腫瘤微環(huán)境中得到的信息。預(yù)期這種整合系統(tǒng)生物學(xué)將會(huì)改善臨床決策的制定。利用NGS來(lái)闡明軀體基因組變異對(duì)治療結(jié)果的影響是重要的***步,即使目前將患者與靶向治療相匹配的嘗試對(duì)罕見(jiàn)突變只表現(xiàn)出較低的可實(shí)施性(13%)。
當(dāng)進(jìn)行NGS或分子譜驅(qū)動(dòng)的試驗(yàn)時(shí),需要將臨床試驗(yàn)變?yōu)橐曰颊邽橹行模ǘ皇且运幬餅橹行模@樣的治療將變得更加個(gè)體化。
目前已經(jīng)開(kāi)展了為個(gè)體患者的疾病訂制特異性治療方法的臨床試驗(yàn)。許多主要癌癥中心為患者提供綜合性分子診斷譜來(lái)擴(kuò)大癌癥基因檢測(cè)的應(yīng)用。單一生物標(biāo)志物檢測(cè)的連續(xù)應(yīng)用具有局限性,這正刺激了廣泛的分子檢測(cè)的發(fā)展。此外,對(duì)循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)的縱向測(cè)序可以提供有關(guān)耐藥和***佳聯(lián)合治療或治療次序的有價(jià)值的信息。腫瘤進(jìn)展可以被看作是動(dòng)態(tài)進(jìn)化過(guò)程,這表明需要評(píng)估新驅(qū)動(dòng)突變的亞克隆表現(xiàn)。展望未來(lái),NGS、RNA測(cè)序的新的應(yīng)用將會(huì)實(shí)現(xiàn)對(duì)腫瘤樣本的基因表達(dá)分析。這將與蛋白質(zhì)組學(xué)等方法一起,進(jìn)一步闡釋基因組變異的功能性作用。
還需要更多的數(shù)據(jù)來(lái)更好的理解腫瘤的時(shí)間和空間異質(zhì)性,以及這些因素對(duì)測(cè)定試驗(yàn)和個(gè)體化治療成敗的重要性。
NGS驅(qū)動(dòng)試驗(yàn)應(yīng)該考慮以下原則
●除腫瘤基因組外,將通路和網(wǎng)絡(luò)的知識(shí)整合在一起,比如轉(zhuǎn)錄因子、表觀基因和蛋白質(zhì)組。
●發(fā)展數(shù)據(jù)分析和治療設(shè)計(jì)的算法。定義標(biāo)準(zhǔn)、數(shù)據(jù)質(zhì)量以及建立算法的數(shù)據(jù)來(lái)源。
●藥物聯(lián)合治療將對(duì)臨床收益***大化和減少耐藥至關(guān)重要。
●盡早治療以使患者結(jié)果***優(yōu)化,腫瘤異質(zhì)性和基因組不穩(wěn)定性會(huì)隨時(shí)間延長(zhǎng)而增加,特別是在腫瘤細(xì)胞內(nèi)部的破壞性進(jìn)展事件之后。
●縱向隨訪患者:對(duì)復(fù)發(fā)腫瘤或轉(zhuǎn)移灶的再次活檢,以及基于血液的測(cè)序(DNA和RNA)對(duì)實(shí)現(xiàn)個(gè)體化、適應(yīng)性治療十分關(guān)鍵。
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