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盡管幾十年來(lái)免疫療法在癌癥治療中取得了一定的成功,但僅有不到10%至20%的癌癥病例表現(xiàn)出了對(duì)免疫檢查點(diǎn)阻滯的持久性反應(yīng),為了提高免疫療法的治療效率,抑制多種免疫逃逸機(jī)制的聯(lián)合療法越來(lái)越受到科學(xué)家們的關(guān)注。近日,一篇發(fā)表在國(guó)際雜志Cell上題為“Pan-Cancer Proteogenomics Characterization of Tumor Immunity”的研究報(bào)告中,來(lái)自臨床蛋白質(zhì)組學(xué)腫瘤分析聯(lián)盟的科學(xué)家們通過(guò)研究揭示了對(duì)癌癥中免疫反應(yīng)的深入了解,這標(biāo)志著這一研究領(lǐng)域的向前邁出了重要的一步。
利用來(lái)自10種不同癌癥中1000多份腫瘤樣本的數(shù)據(jù),研究人員***整合了DNA、RNA和蛋白質(zhì)組,并揭示了腫瘤中免疫細(xì)胞之間的復(fù)雜相互作用。研究者Pei Wang說(shuō)道,我們的目標(biāo)是改進(jìn)對(duì)腫瘤中免疫反應(yīng)的功能損傷背后機(jī)制的理解,通過(guò)仔細(xì)分析腫瘤組織中的基因和蛋白質(zhì)的特性,我們就發(fā)現(xiàn)了免疫激活和抑制的多種模式。文章中,研究人員揭示了這些不同的免疫亞型,旨在幫助臨床研究人員識(shí)別出能對(duì)免疫療法反應(yīng)更好的患者群體,而揭示每種亞型的特定通路和細(xì)胞開(kāi)關(guān)也有望激發(fā)新的和創(chuàng)新性的方法來(lái)幫助開(kāi)發(fā)新型癌癥療法。
科學(xué)家成功描述人類癌癥的免疫景觀藍(lán)圖
圖片來(lái)源:Cell (2024). DOI:10.1016/j.cell.2024.01.027
研究者認(rèn)為,每種類型的免疫反應(yīng)都與基因功能的改變有關(guān),比如基因是如何被修飾的,它們是如何發(fā)送信息的以及如何產(chǎn)生蛋白質(zhì)的,通過(guò)提供對(duì)癌癥中免疫反應(yīng)的***分子指紋,這項(xiàng)研究或有望促進(jìn)科學(xué)家們進(jìn)一步開(kāi)發(fā)新型免疫療法策略。一個(gè)關(guān)鍵的研究發(fā)現(xiàn)就是,在通過(guò)先進(jìn)的統(tǒng)計(jì)模型確定的7種亞型中,有5種亞型包括來(lái)自10種不同類型的腫瘤,這就表明這些腫瘤之間或許存在共同的免疫反應(yīng)。研究者Wang表示,當(dāng)我們看到相同的免疫組中不同癌癥的細(xì)胞行為方式存在的共同免疫反應(yīng)和相似模式時(shí),其或許就暗示著,增強(qiáng)免疫系統(tǒng)功能的特定療法可能對(duì)多種癌癥類型都有效。
這項(xiàng)研究的一個(gè)新的方面來(lái)源于對(duì)1000多種腫瘤所產(chǎn)生的深度磷酸化蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)就能促使研究人員觀察這些蛋白質(zhì)被修飾的分子機(jī)制。通過(guò)對(duì)1000多個(gè)泛癌癥腫瘤的磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)研究,研究人員就能發(fā)現(xiàn)一組關(guān)鍵的新型藥物靶點(diǎn)。通過(guò)利用小分子或其它方法來(lái)靶向作用選定的激酶,研究人員就能將對(duì)免疫療法沒(méi)有反應(yīng)的腫瘤轉(zhuǎn)化成為對(duì)免疫療法能產(chǎn)生更好反應(yīng)的腫瘤。作為研究的一部分,一種用于數(shù)字病理圖像的機(jī)器學(xué)習(xí)工具也能證明不同類型免疫反應(yīng)與某些免疫細(xì)胞存在之間的關(guān)聯(lián),從而就會(huì)增強(qiáng)對(duì)腫瘤內(nèi)部和周圍環(huán)境特性的理解。
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