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Cell 期刊***發(fā)布了衰老的九類細(xì)胞和分子特征,為后續(xù)的衰老研究提供了背景框架和指導(dǎo)作用。然而,隨著衰老研究與技術(shù)手段的不斷更新,衰老特征已經(jīng)上升至 14 類:除此前發(fā)布的九類特征之外,自噬受損、RNA 剪切失調(diào)、微生物組干擾、機(jī)械性能改變與炎癥作用被納入其中。
衰老特征的不斷更新足以說明老化過程的復(fù)雜性。也因此,僅憑借單一指標(biāo)判斷人體的衰老進(jìn)程并不準(zhǔn)確。對此,專注于以數(shù)據(jù)研究衰老的測試實驗室 TruDiagnostic 決定與哈佛大學(xué)的研究人員開展合作,試圖通過 DNA 甲基化數(shù)據(jù)來量化生物衰老,從而創(chuàng)建更加可靠、信息更加豐富的生物年齡測量方法。
日前,TruDiagnostic 以預(yù)印本形式發(fā)表了年齡時鐘 OMICmAge 的***新研究。研究結(jié)果表明,基于新型甲基化算法創(chuàng)建的表觀遺傳時鐘 OMICmAge 能夠以約 90% 的準(zhǔn)確率預(yù)測被測試者在 10 年內(nèi)的死亡概率。研究者提示道,如果是依靠被測試人的實際年齡進(jìn)行預(yù)測,那么預(yù)測的準(zhǔn)確率僅為 75.6%。
除此之外,OMICmAge 還可以突出顯示哪些器官系統(tǒng)疾病可能會發(fā)生功能障礙甚至加速衰老,從而獲知影響個體衰老進(jìn)程的***大風(fēng)險因素,為早期干預(yù)或改善個體衰老生物學(xué)提供幫助。
(來源:bioRxiv)
據(jù)悉,該研究項目于 2020 年底啟動,其專門創(chuàng)建了一個迄今為止***大的多組學(xué)老齡化數(shù)據(jù)集(MGH-ABC),并根據(jù)該數(shù)據(jù)集分析了超過 30,884 名參與者的衰老生物標(biāo)志物。此外,研究者在 5,000 人的精選小組中進(jìn)行了***代謝組學(xué)、表觀遺傳學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分析。
“在該研究中,我們著手創(chuàng)建量化生物衰老過程的***佳方法。然而,衰老是極其復(fù)雜的,因此我們嘗試使用跨組學(xué)數(shù)據(jù)解決該問題?!惫疳t(yī)學(xué)院副教授 Jessica Lasky-Su 解釋道。為此,研究者將表觀遺傳甲基化數(shù)據(jù)與代謝、蛋白質(zhì)等多個組學(xué)的量化數(shù)據(jù)聯(lián)系起來,從而能夠深入了解各種衰老特征和各種復(fù)雜的生物衰老過程。
“該算法能夠利用甲基化數(shù)據(jù)預(yù)測其他組學(xué)的指征,例如空腹血糖或甘油三酯?!盩ruDiagnostic 的生物信息學(xué)主管 Varun Dwaraka 對此解釋道,“通過開發(fā)這些臨床和分子預(yù)測因子,我們可以更好地解決隨年齡增長而發(fā)生的多種變化,并可以確定各種導(dǎo)致人們衰老的原因。”
▲圖丨OMICmAge 中的表觀遺傳學(xué)生物標(biāo)志物
除此之外,研究者還能夠預(yù)測 OMICmAge 變化可能會對個人壽命產(chǎn)生哪些影響。例如,如果 OMICmAge 為 60 歲的人能夠?qū)⒛挲g逆轉(zhuǎn)一歲,那么他們的預(yù)計生存時間將增加 1.7 年。而對于 OMICmAge 為 70 歲的人來說,那么該操作可能導(dǎo)致壽命被延長 1.35 年。
ctDNA的提取在腫瘤篩查中,是重要的前置步驟。目前常用的提取方法是利用生物磁珠,主要是硅羥基磁珠或羧基磁珠對血清血漿的ctDNA進(jìn)行提取,由于磁珠的粒徑小,比表面積大,在特定提取緩沖液中,對核酸的吸附會更加靈敏,相比于其他方法,使用生物磁珠對進(jìn)行ctDNA提取得率會更高,檢測靈敏度和檢出限也會更合適,搭配核酸提取儀,更能實現(xiàn)全程自動化的提取。
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